La gonorrhée se traduit par des symptômes qui touchent les organes génitaux, mais aussi le rectum, la gorge et, parfois, les yeux. Quelques jours après la contamination, les symptômes de la gonorrhée apparaissent.
Chez certains hommes, la gonorrhée ne produit pas de symptômes (mais ces personnes restent contagieuses). Lorsque des symptômes apparaissent, les hommes infectés se plaignent de picotements ou de brûlures en urinant, ou d'écoulements blanchâtres au niveau du pénis ou du rectum. Parfois, les testicules sont enflés ou douloureux.
La gonorrhée est plus rarement symptomatique chez les femmes (elle l'est dans moins de 25 % des cas). Lorsque c'est le cas, les femmes infectées souffrent de sensation de brûlures en urinant ou pendant les rapports sexuels, d'écoulements vaginaux jaunâtres ou sanguinolents et de maux de ventre.