Si la rubéole reste le plus souvent bénigne chez l'enfant, certaines complications peuvent néanmoins apparaître : une atteinte inflammatoire de plusieurs articulations qui disparaît sans séquelles au bout de quelques semaines, voire une atteinte inflammatoire des méninges (méningite) et du cerveau.
La contamination par la rubéole d'une femme enceinte est extrêmement dangereuse pour le foetus, en particulier en début de grossesse. À la naissance, l'enfant peut présenter des lésions du cerveau, une surdité, une cécité, des anomalies cardiaques, un retard de croissance ou d'autres handicaps. On constate également un risque d'avortement ou de prématurité.